电子显微镜，简称电镜，英文名称Electron Microscope（EM）经过50多年的发展，已成为现代科学技术中不可或缺的工具。电子显微镜由镜筒，真空装置和电源柜组成。

电子显微镜的应用基于分辨率为0.2μm的光学显微镜和分辨率为0.2nm的透射电子显微镜，这意味着透射电子显微镜基于光学显微镜放大1000倍。

电子显微镜和光学显微镜的光源不同。电子显微镜中使用的照明源是电子枪发射的电子流，光学显微镜的照明源是可见光（日光或光）。由于电子流的波长比光波的波长短得多，因此电子显微镜的放大率和分辨率显着高于光学显微镜的放大率和分辨率。

电子显微镜和光学显微镜镜头不同。用于在电子显微镜中放大的物镜是电磁透镜（能够在中心部分产生磁场的圆形电磁线圈），并且光学显微镜的物镜是由玻璃制成的光学透镜。电子显微镜中有三组电磁透镜，相当于光学显微镜中聚光镜，物镜和目镜的功能。

电子显微镜和光学显微镜成像原理不同。在电子显微镜中，作用在待检查样品上的电子束通过电磁透镜放大，然后在荧光屏上成像或施加到光敏膜上进行成像。电子暗度差异的机理是当电子束作用于待测样品时，入射电子与物质原子碰撞产生散射。

由于样品的不同部分对电子具有不同的散射程度，因此样品的电子图像以阴影呈现。光学显微镜中样品的图像由亮度差异表示，亮度差异是由被检样品的不同结构吸收的光量差异引起的。

电子显微镜和光学显微镜所用样品的制备方法不同。用于电子显微镜观察的组织细胞标本的制备过程复杂，技术难度大，成本高，在材料采集，固定，脱水，嵌入等步骤中需要特殊的试剂和操作。

嵌入式将组织块置于超薄切片机上并切成50-100nm厚的超薄样品。通过光学显微镜观察的样本通常放置在载玻片上，例如常见的组织切片样本，细胞涂片样本，组织沉淀样本和细胞液滴样本。

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